Peu après la mort de Phagspa, la dispute du pouvoir commença au sein de la famille des Gum de Sagya qui prenait en main le pouvoir local du Tibet. Après avoir succédé à Phagspa au poste du dishi, Dama Barla, neveu de Phagspa, déclara que Daniqenbo Sangbobei, son cousin, n'était réellement pas du sang de la famille des Gum. Cet homme fut donc exilé par Kubilay à Hangzhou, au sud du Yangtse. Jusqu'à la mort de Dama Barla, personne ne put lui succéder, l'empereur Chengzong des Yuan dut faire revenir Daniqenbo Sangbobei, en reconnaissant qu'il était membre de la famille des Gum et en lui ordonnant de prendre plusieurs ferames afin de donner naissance à plus d'enfants. Par conséquent, Daniqenbo Sangbobei eut sept femmes et douze enfants. Après la mort de Daniqenbo Sangbobei en 1322, de nouvelles contradictions s'élevèrent au sein de la famille des Gum. En 1325, le dishi Gumga Lobzhui Gyaincain, fils de Daniqenbo Sangbobei, classa ses frères consanguins en quatre systèmes de lhazhang : Xitog, Lakang, Ringqengang et Dorqoi. II distribua les pouvoirs et les titres nobiliaires conférés à la famille des Gum par l'empereur des Yuan respectivement aux fils de quatre concubines de son père, plus précisément, le poste de chef du monastère Sagya au lazhang Xitog, le poste de dishi au lazhang Lakang, le droit de succession au poste TwucMu'ste de Sagya (azhang Ringqengang et titre de prince de Bailan à Dorqoi). En outre, les quatre lhazhang possédaient leur propre monastère qui pouvait être légué de père en fils. Sur le plan économique, les lhazhang avaient leur propre peuple dépendant, manoir et château. Le statut des lhazhang était plus haut que celui des chefs des treize wanhu. Plus tard, cependant, ils se trouvèrent devant le défi du wanhu de Pagzhu, et leurs faiblesses furent mises en évidence. La puissance et l’influence de la secte Sagya faiblirent rapidement.
Au moment où le pouvoir de Sagya était plongé dans la crise, la vallée de Yalong dans la région de Shannan se dressa sans bruit sous la direction de Jamqoi Gyaincain (1302-1364) de la famille des Nam. Dès sa jeunesse, Jamqoi Gyaincain passa auprès de Daniqenbo Sangbobei, chef de la secte Sagya, et étudia le bouddhisme et le traitement des affaires administratives. C'était une coutume de maintien des relations entre les chefs des wanhu et le pouvoir des Sagya. Après être devenu, en 1322, chef du wanhu, Jamqoi Gyaincain entreprit la mise en ordre du système de mandarinat, intensifia le développement économique et forma une armée puissante. Il estima qu'il fallait récupérer toutes les terres du fief qui devaient appartenir au wanhu de Pagzhu selon les décrets de Kubilay et du Conseil des affaires de pacification, mais étaient contrôlées par Xulewu et d'autres chefs des wanhu. Cette pensée correspondait non seulement aux décrets du gouvernement des Yuan, mais également à la volonté des seigneurs et du peuple dépendant de Pagzhu. Après une dizaine d'années de lutte, Jamqoi Gyaincain vainquit finalement le wanhu de Yarsang et récupéra les terres perdues. La puissance croissante du wanhu de Pagzhu inquiéta le pouvoir des Sagya. Ce dernier usa de pression contre le wanhu de Pagzhu sous prétexte de régler des différends, et essaya à maintes reprises de destituer, par des moyens légitimes, Jamqoi Gyaincain de ses fonctions.
II essuya un échec face à la résistance de Jamqoi Gyaincain. En 1346, boinqen Gyawa Sangbo de Sagya réunit les armées des wanhu de Cebag et de Yamzhog qui craignaient aussi la puissance du wanhu de Pagzhu, pour attaquer Nedong de Pagzhu. Lors des entretiens entre les deux parties, Jamqoi Gyaincain fut arrêté et son adversaire le força à remettre Nedong. Du fait que Jamqoi Gyaincain avait pris à l'avance les dispositions nécessaires, le boinqen Gyawa Sangbo ne put occuper Nedong et Jamqoi Gyaincain fut conduit sous escorte. Justement à ce moment critique, la lutte interne de Sagya éclata. Gyawa Sangbo fut destitué de ses fonctions et Jamqoi Gyaincain fut libéré et retourna à Nedong. En août 1348, le boinqen Wangzoin de Sagya rassembla encore une fois les armées de Cebag et de Yamzhog pour lancer une nouvelle attaque contre Pagzhu.
Or, à cause du commandement erroné et des mauvais termes internes d'une part, et de la résistance opiniâtre de 1'armée de Pagzhu animée d'une même volonté d'autre part 1'armée alliée de Sagya essuya défaite sur défaite et 1'armée de Pagzhu occupa la plupart des territoires de Yarsang et obligea le wanhu de Cebag à céder du terrain pour obtenir la paix. En 1350 Jamqoi Gyaincain envoya son envoyé à la capitale pour présenter un compte rendu à 1'empereur. L'empereur Shun des Yuan ratifia le pouvoir et le statut obtenu par Jamqoi Gyaincain et lui octtoya deux sceaux en argent. En 1353, Pagzhu défit encore une fois l'armée alliée de Cebag et de Zhigong, mobilisée par le pouvoir de Sagya. Profitant des contradictions au sein de Sagya, Jamqoi Gyaincain s'allia avec Gyawa Sangbo, contexe-attaqua Sagya, occupa le monastère Sagya et la plupart de régions d'Ü-Tsang et prit la place de la secte Sagya qui dominait le Tibet. En 1358, Jamqoi Gyaincain saisit le sceau officiel du boinqen de Sagya et, selon l'ordre de l'empereur des Yuan, envoya dans la capitale Soinam Lozhoi assumer les fonctions de dishi. En 1360 Jamqoi Gyaincain envoya Xirab Zhaxi et d'autres personnes demander à l'empereur l'octroi de titres honorifiques.
L'empereur Shun des Yuan conféra à Jamqoi Gyaincain un sceau en forme de tête du tigre et une lettre de nomination, décida de placer les régions de Konggar et de Rinbang sous sa juridiction et nomma Sakya Ringqen, subordonné de Jamqoi Gyaincain, chef du wanhu de Qumi. La cérémonie de lecture du décret impérial de nomination eut lieu à Nedong avec la participation du maréchal mongol et les fonctionnaires des bureaux des commissaires de pacification d'Ü-Tsang. Ensuite, selon la règie de la secte Pagzhu, la cérémonie de première utilisation du nouveau sceau officiel de Jamqoi Gyaincain (équivalent au sceau du boinqen de Sagya) se tint solennellement au monastère Dansati. Cela indiquait que le pouvoir de Sagya de gouverner les régions d'Ü-Tsang était remplacé officiellement par le pouvoir de Pagzhu.